به گزارش ساعد نیوز ،محمدرضا شجریان در سال 1340 و در بیست و یک سالگی با خانم فرخنده گل افشان ازدواج کرد. خانم گل افشان هم مثل خود شجریان معلم دبستان بود و هر دوی آن ها در شهر قوچان تدریس می کردند و در همین شهر هم پای سفره عقد نشستند. شجریان آواز می خواند و ساز می ساخت و به باغبانی علاقه داشت و خانم گل افشان ، به گلسازی می پرداخت. پس از دو سال ، فرزانه اولین فرزند محمدرضا شجریان متولد شد. دومین فرزند هم به نام افسانه در سال 1344 به دنیا آمد. مژگان سومین فرزند این خانواده هنرمند در سال 1348 به دنیا آمد و آخرین فرزند محمدرضا شجریان و فرخنده گل افشان هم همایون بود که روز 31 اردیبهشت سال 1354 به دنیا آمد.